Multilocus Sequence Typing (MLST): เทคนิคระดับโมเลกุลเพื่อติดตามความปลอดภัยในอาหาร

Abstract

ปัจจุบันโรคติดเชื้อทางเดินอาหารถือเป็นปัญหา สาธารณสุขทั่วโลกโดยเฉพาะในประเทศแถบเขตร้อน วิธีการตรวจสอบแหล่งที่มาของการติดแบคทีเรีย ก่อโรคทางเดินอาหารสามารถทำได้โดยการศึกษา ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของสายพันธุ์ที่แยกได้จาก ผู้ป่วยโรคอุจจาระร่วงและที่แยกได้จากแหล่งต่างๆ รวมทั้งอาหาร Multilocus Sequence Typing (MLST) เป็นวิธีการวิเคราะห์ทางพันธุกรรมและการจำแนกชนิด แบคทีเรียโดยใช้หลักความสัมพันธ์ของรหัสพันธุกรรม ของยีนพื้นฐาน (Housekeeping Genes) ของแบคทีเรีย ที่แยกได้จากแหล่งต่างๆเพื่อวิเคราะห์ความใกล้ชิด ของสายพันธุ์และใช้ในการระบุแหล่งการแพร่กระจาย ของเชื้อก่อโรค ข้อได้เปรียบที่สำคัญของวิธี MLST กับวิธีทางโมเลกุลประเภทอื่นคือ สามารถเปรียบเทียบ ความสัมพันธ์ของสายพันธุ์ที่ศึกษากับสายพันธุ์อื่น จากทั่วโลกได้โดยผ่านฐานข้อมูลทางอินเทอร์เนต ในปัจจุบันนำวิธี MLST มาใช้อย่างแพร่หลายในด้าน วิทยาการระบาดและวิวัฒนาการของแบคทีเรียก่อโรค ในอาหารที่สำคัญหลายชนิด ข้อมูลที่ได้จากวิธี MLST สามารถนำไปใช้ประโยชน์ในการตรวจตราการปนเปื้อน แบคทีเรียก่อโรคในอุตสาหกรรมอาหาร ส่งผลให้ ระบบรักษาความปลอดภัยในอาหารมีมาตรฐานสูงขึ้น

Foodborne infectious diseases are a worldwide public health burden particularly in tropical countries. Determining potential sources of infection has mitigated transmission of bacteria. Sources of bacterial enteric infection could be identified by genetic relatedness of strains isolated from patients with diarrhea and strains isolated from various sources including food. Multilocus sequence typing (MLST) is a genetic analysis used to identify bacterial strains based on nucleotide sequences of housekeeping genes of bacteria collected from various sources. MLST analysis allows understanding of genetic relationships and sources of bacteria transmission. The advantage of MLST over other molecular methods is the ability to compare genetic profiles of examined strains from individual laboratories to those from over the world through online database. At present, the MLST approach has been successfully applied in epidemiological and molecular evolutionary studies of several foodborne pathogenic bacteria. Generated outcomes from MLST could imporve surveillance of bacterial pathogens in food industry and generate higher standard of food safety.